KOD OneTM PCR Master Mix
KOD OneTM PCR Master Mix -Blue-实验例14:基因表达载体间的替换
数据提供 : 庆应义塾大学 理工学部 生命分子工学研究室 藤原 庆
<实验目的>
分别将克隆的基因克隆到另外的表达载体。
<实验方法>
【样品的种类】
Plasmid DNA
【样品的制备方法】
用试剂盒提纯的DNA
【目的片段基因名称与长度】
载体A(pET15由来)
6,050bp
大肠杆菌基因A-H
1,000~2,000bp
【引物序列】
载体用
Forward Primer : 长度 : 20nt Tm : 55.4℃
Reverse Primer : 长度 : 18nt Tm : 56.9℃ 基因用
Forward Primer : 长度 : 23nt Tm : 58.8℃
Reverse Primer : 长度 : 21nt Tm : 53.8℃
【相同区域】
(本次实验中,因为引物序列中含有与替换质粒本身有相同的序列、相同的区域)
Forward : 81nt
Reverse : 117nt
【反应液的组成】 【PCR循环】
(μL)
灭菌蒸馏水 1.4 98℃ 1min.
KOD One® PCR Master Mix 2.5 96℃ 10sec. 25cycles
3μM Primer F 0.5 55℃ 10sec.
3μM Primer R 0.5 72℃ 10-35sec.
50ng/μL Template 0.1
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Total Volume 5.0
【检测仪器】ChemiDoc MP (Bio-Rad)
PCR之后,向 5μL反应液中添加DpnI(NEB) 0.1μL
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37℃ 40分钟(这期间进行电泳)
↓
1.5μL Vector与1μL基因混合,再与12Μl的 iVEC3株感受态细胞混合
(使用的感受态细胞是由资源研究所提供的冻存细胞,按照protocol制作的感受态细胞)
↓
On ice 20分钟
↓
添加LB培养基 400Μl,37℃静置60分钟
↓
离心(12,000xg 30秒),回收菌体,弃上清
↓
用10μL的10mM Tris-HCl(pH8.0)悬浊,然后涂板
↓
第二天,取长出的克隆,使用KOD One进行菌落PCR(1个样品合计用3μL的反应体系)
< 结果・讨论>
各基因产生一个克隆。8个克隆中有7个转化成功。
<感受及建议等>
使用该酶替换了其他公司的高速PCR酶,载体的扩增效率成倍提高,且载体PCR几乎没有失败的。另外,通过iVEC3方法进行基因重组,从PCR到涂板只需要2小时即可完成。