KOD FX 实验例21~22
实验例 5: Human转录因子(HNF3b, C/EBPβ, FTF及HNF6)cDNA与miR-17,18,19,20,92区域genomic DNA的扩增 |
【基因名、目的片段长、及引物序列】
●HNF3b (目的片段长:1.4kb)
引物 5'ACTCGAATTCCAGTATGCTGGGAGCGGTGAAGA3’
5'AAGGGGTACCAGAGTTAGCCGGGCCTGAA3'
●C/EBPβ (目的片段长:1.0kb)
引物 5'ATTAGAATTCGTTCATGCAACGCCTGGTGGCC3'
5'CGCGGGTACCGCGCTAGCAGTGGCCGGAGGA3'
●FTF (目的片段长:1.6kb)
引物 5'CTATGAATTCACTAAGAATGTCTTCTAATTC3'
5'ATTCGATATCTTTAAAGCAAGTTTTTAA3'
●HNF6 (目的片段长:1.4kb)
引物 5'TCGCGAATTCCACGATGAACGCGCAGCTGACCAT3'
5'CTTTGGTACCGAGGTTTTAGTTTGTGGTTCT3'
● miR-17,18,19,20,92領域 (目的片段长:1.1kb)
引物 5'GGTTACTAGTTGTTAGAGTTTGAGGTGTTA3'
5'TATGACTAGTCATATCGCAATACTTAACAG3
(红字表示homologous sequence)
【样品】
HNF3b, C/EBPβ,FTF,HNF6:
人肝癌由来细胞株HuH7由来cDNA(0.1μg Total RNA相当)
miR-17~92:
人肝癌由来细胞株HuH7由来Genomic DNA 0.2μg
【循环】
KOD FX:
94℃ 2min-
(98℃ 10sec, 55℃ 30sec, 68℃ 2min) ×40cycles
其他公司酶:推荐条件
【数据提供】
金泽大学癌症研究所细胞信息调节
黑木 和之 老师
【来自老师的评语】
很容易得到各种克隆,很惊讶。
实验例6: 连接植物表达启动子的植物病毒cDNA扩增 |
【基因名】发现Promoter+植物病毒cDNA
【样品】质粒DNA 0.2μg
【目的片段长】11kb
【引物】21 mer(GC=21%)
【循环】
KOD FX:
94℃, 2.5min.,
(94℃, 15sec., 57℃, 15sec., 68℃, 7min.) x 25
A公司Long PCR酶、高保真性酶:
94℃, 2.5min.,
(94℃, 15sec., 57℃, 15sec., 72℃, 7min.) x 25
【数据提供】
日本大学生物资源科学部 植物病理学研究室 井村 喜之 老师
【来自老师的评语】
相比A公司的Long PCR酶,KOD FX的扩增效率要出色许多。而用A公司的高保真性酶,则无论用什么样的条件都无法得到扩增。
而且,50μl的反应体系用1U的KOD FX就足够得到良好的结果。