用途
PCR
说明
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KOD FX是在KOD DNA polymerase基础上开发的高性能PCR试剂。 |
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特征
●高扩增成功率
对高GC含量的目的片段、细胞悬浊液、小鼠尾巴/植物裂解液、全血、霉菌、酵母等粗样品也可进行高成功率扩增。
●超群的扩增效率
由于得率很高，因此即便模板量很少也可进行扩增。
●出色的延伸性
已确认：以λDNA为模板可以扩增出40kb；以人类基因组DNA为模板可扩增出24kb；以cDNA为模板可扩增出13.5kb。
●通过热启动提高了PCR的反应效率
通过将2种抗KOD单克隆抗体预混合在酶中，抑制了PCR反应前常温状态下的多聚酶活性和3'→5' Exonuclease活性。抗体在PCR最初的变性步骤即发生失活，但对扩增反应没有任何影响。
实验例
1. 碱裂解法制备的鼠尾裂解液的扩增例
向直接PCR反应液中添加碱裂解法(请参照右边的基本反应条件)制备的鼠尾裂解液0.5μl，以Mouse membrane glycoprotein(Thy-1)gene(M10246)为目的基因，用2步法循环，作30个循环的扩增。
结果显示，只有使用KOD FX时，才可以确认到明确的扩增。碱裂解法，相比使用Proteinase K的方法，操作简单，可以更加简便地分析转基因鼠的基因。
另外，扩增产物无须纯化，以下是用几种限制性内切酶消化处理的结果，可以确认扩增产物可被内切酶完全消化切断。
2. 一步法制备的植物裂解液的扩增例
向直接PCR反应液中添加一步法(请参照右边的基本反应条件)制备的番茄、烟叶、稻叶及精米裂解液1μl，以rbcL为目的基因，用2步法循环，作30个循环的扩增。
结果显示，只有使用KOD FX时，才可以确认到明确的扩增。通过将一步法与KOD FX组合，就可以简便地对植物基因进行分析。
3. 模板DNA量的探讨
使用KOD FX与其他公司的PCR酶，比较了模板DNA的量与扩增效率。
扩增反应中，以0.1ng～100ng的基因组DNA为模板，以human β-globin 2.8kb为目的基因，50μl反应体系，引物15pmoles，KOD FX使用了1U，按2步法，作了30个循环的扩增。
结果显示，相比其他公司的PCR酶，KOD FX可以得到更高的扩增效率。
※其他的实验例
实验例6: 挑战扩增真核细胞最长基因DMD(13.5Kb)的PCR克隆
实验例27: 使用从人粪便提纯的DNA扩增Helicobacter pylori cagA基因
实验例29: 用DGGE法对沿海生息的植物-浮游生物(隐藻cryptophyta)的多样性分析
实验例32: 对病原酵母Cryptococcus neoformans菌体(菌落)的直接PCR
实验例33: 对米曲菌(Aspergillus oryzae)直接PCR
实验例35: 使用KOD FX对黄色黑腹果蝇羽翼的简便Long PCR法
实验例37: 用KOD FX扩增淡水刚毛藻属藻类（绿藻）DNA片段
实验例38: 用KOD FX对曲霉菌Aspergillus oryzae基因破坏的确认
实验例39: 用KOD FX通过菌落直接PCR检测各种细菌DNA
实验例40: 高成功率PCR酶 用KOD FX对指甲直接进行PCR
参考文献
1) K. Wakahara et al., Mol Cancer Res 6: 1937-1945.(2008)
2) N. Yamada et al., Mol Vis., 15::974-979.(2009)
- 产品内容
KOD FX(1U/μl)200μl×1支
2×PCR Buffer*[KFX-1B]1.7ml×3支
2mM dNTP**[NTP-201]1ml×2支
*含有终浓度2.0mM的Mg 2+ 。
** 使用本酶进行PCR时，请使用dNTPs[NTP-201]。如果使用其他的dNTPs，有时可能得不到良好的扩增性能。
※50μl反应体系的情况下可使用200次。
组分:
50mM Tris-HCl(pH8.0)
0.1mM EDTA
1mM DTT
0.001% Tween ® 20
0.001% Nonidet ® P-40
50% Glycerol
活性的定义:
在75℃活性测定条件下，在30分钟内摄入10nmoles的全核苷酸使成为酸不溶物时所需酶的活性定义为1U。
来源:
E.coli 重组体
- 基本反应条件
灭菌蒸馏水X μl
2×PCR buffer for KOD FX25μl
2mM dNTPs10μl（0.4mM）
各引物15pmoles each
模板1～50ng(Plasmid)
10～200ng(Genome DNA)
～200ng[RNA相当](cDNA)
～2μl(粗样品)
〈一步法植物裂解液1μl〉
KOD FX (1U/μl)1μl(1U)
Total Volume50μl
〈2步法循环〉*
94℃ 2min.
↓
98℃ 10sec.
68℃ 1min./kb 25～40 cycles
〈3步法循环〉*
94℃ 2min.
↓
98℃ 10sec.
(Tm-5)℃ 30sec.
68℃ 1min./kb 25～40 cycles
〈Step down循环〉*
94℃, 2min.
↓
98℃, 10sec.
74℃, 1min./kb 5 cycles
↓
98℃, 10sec.
72℃, 1min./kb 5 cycles
↓
98℃, 10sec.
70℃, 1min./kb 5 cycles
↓
98℃, 10sec.
68℃, 1min./kb 15～25 cycles
↓
68℃, 7min.
*基本上以2步法循环进行。引物的Tm值低于68℃或用2步法循环未见扩增时，请试一下3步法循环。另外，扩增10kb以上的目的片段时，如果出现Long PCR片段或非特异条带及弥散，请试一下Step down循环。 ※Tm值采用最邻近法（Nearest Neighbor method）计算得到的值。
引物的Tm值以及扩增产物的Tm值计算请点击此处进入在线工具
<碱裂解法>
1) 将鼠尾(约3mm)放入离心管中。
2) 添加50mM NaOH 180μl。
3) Vortex充分振荡。
4) 95℃・10min.
5) 添加Tris-HC(l pH8.0) 20μl。
6) Vortex充分振荡。
7) 离心(12,000rpm, 10min.)
8) 取0.5～2μl上清进行PCR反应。
(鼠尾不会也无需完全溶解)
<一步法>
1) 将叶片(3mm)或精米(1粒) 放入离心管中。
2) 添加Buffer A* 100μl。
3) Vortex充分振荡。
4) 95℃・10min.
5) Vortex充分振荡。
6) 离心(12,000rpm, 10min.)
7) 取1μl上清进行PCR反应。
(植物组织不会也无需完全溶解)
*Buffer A:
100mM Tris-HC(l pH9.5)
1M KCl
10mM EDTA
- 几点建议
●PCR产物的克隆
由于本酶的PCR产物已被平滑化，可用平滑末端克隆法进行克隆。此时，如已对载体进行了脱磷酸化处理，就需要对PCR产物进行磷酸化，或使用带5'磷酸基的引物。另外，由于本酶的PCR产物已被平滑化，不能直接进行TA克隆。可使用按以下方法开发的TA克隆专用试剂盒「TArget Clone -Plus-」。
●关于引物
扩增超过10kb的目的片段时，推荐使用OPC以上纯化级度，27mer以上的引物。另外，3'端有错配的引物，可能会受到本酶校正。
Tm值采用最邻近法(Nearest Neighbor method)计算得到的值。引物的Tm值以及扩增产物的Tm值计算请点击此处进入在线工具。
相关产品
(单独销售的组分)
| 品名 | Code No. | 包装 | 价格 | 保存温度 | 说明书下载 |
|---|---|---|---|---|---|
| 2× PCR buffer for KOD FX | KFX-1B | 1.7ml×1支 | RMB 100 | -20℃ | - |
| dNTPs Mixture(2mM) | NTP-201 | 各2umoles/1.0ml × 1支 | RMB 65 | -20℃ | - |
●KOD系列高效率TA克隆试剂盒
| 品名 | Code No. | 包装 | 价格 | 保存温度 | 说明书下载 |
|---|---|---|---|---|---|
| TArget Clone™-Plus- | TAK-201 | 10次份 × 1支 | RMB 380 | -20℃ |
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