KOD FX实验例30: 使用KOD FX的绿脓菌DNA的基因扩增
实验例14:使用KOD FX的绿脓菌DNA的基因扩增 |
【样品※】绿脓菌(Pudomonas aeruginosa K767)的染色体DNA
【基因名※】PA5471
【目的片段长】约1.5 kbp
【引物序列※】
Primer F:5’-GCTAGAATTCGATCTACCGTTTCAATCACATGGAT-3’
Primer R:5’-GATCTCTAGAGGCCACCTCCTCGATTACCT-3’
※参考文献
Morita Y, Sobel ML, Poole K.J Bacteriol. 2006 Mar;188(5):1847-55.
【反应液组成】
<使用KOD FX>
PCR grade water** 0.8 μl
2 × PCR buffer for KOD FX 5 μl
2 mM dNTPs 2 μl
4 μM Primer F 0.75 μl
4 μM Primer R 0.75 μl
模板DNA* 0.5 μl
KOD FX(1.0 U/ml) 0.2 μl
-------------------------------------------------------------
Total 10μl
<使用A公司通用酶(Taq Base)>
PCR grade water** 6.16 μl
10 × ExTaq buffer 1 μl
10 mM dNTPs 0.8 μl
4 μM Primer F 0.75 μl
4 μM Primer R 0.75 μl
模板DNA* 0.5 μl
A公司通用酶(5 U/ml) 0.04 μl
--------------------------------------------------------------
Total 10μl
*约5 μg/μl浓度的绿脓菌染色体DNA按100倍梯度连续稀释。
**使用DMSO时,按终浓度4 %添加DMSO。
※其他公司产品按其说明书配制反应液。
PCR循环】
94 ℃ 2 min
↓
(94 ℃ 15 sec,60 ℃ 30 sec,68 ℃ 2 min)35 cycles
↓
68 ℃ 5 min
【结果】
【数据提供】
爱知学院大学药学部微生物教研室
森田 雄二 老师
【来自老师的评语】
使用KOD FX,即便不添加DMSO,也可观察到PCR产物。
添加了DMSO的情况下,用KOD FX特异性更高,可观察到非常清晰的条带。