KOD FX实验例31: 小鼠尾巴裂解液的基因组DNA的扩增
◆实验1. 使用小鼠尾巴溶解液的PCR效率比较 |
◆实验2. 使用质粒样品的PCR效率比较 |
【样品】
实验 1) mouse tail lysed with Proteinase K 0.5μl
实验 2) Plasmid (20ng)
【目的片段】目的片段基因名、扩增片段大小
实验 1) pGKneo, 500 bp
实验 2) CAG promoter region + GFP, 3 kb
【目的片段序列】
实验 1) forward, reverse共に20 mer
实验 2) forward, 21 mer; reverse, 29 mer
【反应液组成】
●KOD FX
PCR grade water X μl
2x PCR buffer for KOD FX 7.5 μl
2mM dNTPs 3 μl
10pmol /μl Primer #1 0.45 μl
10pmol /μl Primer #2 0.45 μl
KOD FX (1.0U/μl) 0.3 μl
样品 Y μl
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Total reaction volume 15 μl
※其他公司产品按其说明书推荐的条件。
【循环】
实验 1)
95℃ 2min
↓
(95℃ 30 sec, 56℃ 30 sec, 72℃ 30 sec) 36 cycles
↓
4 ℃, forever
实验 2)
95℃ 2 min
↓
(98℃ 10 sec, 60℃ 30 sec, 72℃ 3 min) 33 cycles
↓
4 ℃, forever
【数据提供】
高知大学医学部解剖学教研室
三井 真一 老师
【来自老师的评语】
扩增效率超乎想象,非常吃惊。
小鼠尾巴的处理如下:
在切成长度约3〜5 mm的小鼠尾巴中添加500 μl的Lysis buffer (100 mM Tris-Cl, pH8.5, 5 mM EDTA, 200 mM NaCl, 1 mM CaCl2, 0.2% SDS, 100μg/ml Proteinase K),56℃条件下放置一个晚上混合。将该溶解液的0.5 μl作为模板添加到反应液中。不进行Proteinase K失活操作。通过过夜处理使其自身分解失活。根据经验,添加过剩的液量、尾巴的溶解时间过短(几个小时;尾巴刚刚溶解不久)等,会出现条带不清晰的情况。