KOD FX实验例32: 对病原酵母Cryptococcus neoformans菌体(菌落)的直接PCR
实验例16:对病原酵母Cryptococcus neoformans菌体(菌落)的直接PCR |
M:1kb DNA Ladder
1~5:Cryptococcus neoformans 菌株No.(1:Positive Control[野生型菌株]、2:Negative Control[基因缺损菌株]、3~5:基因互补菌株)
【样品】
病原酵母Cryptococcus neoformans菌体(菌落)
【前处理】
无(直接使用菌落)
【目的片段】
任意的酶基因 1.8 kb
【引物】
20碱基(序列非公开)
【反应液组成】
KOD FX:Buffer 25 μl、2.5 mM dNTP 4μl、引物各10 pmol、KOD FX 1μl、加蒸馏水定容至50 μl。之后用牙签挑取菌体,放入反应液中少量悬浊。
A公司高效率PCR酶:Buffer 5μl、2.5 mM dNTP 4μl、引物各10 pmol、酶 0.2μl、蒸馏水定容至50 μl。
模板DNA使用C. neoformans菌落和抽提的DNA。使用菌落时,用牙签挑取放入反应液中少量悬浊。使用抽提的DNA时,添加1 μl。
【PCR 循环】
94℃ 5 min
↓
(94℃ 30 sec, 60℃ 30 sec, 72℃ 1.5 min) 30 cycles
↓
72℃ 5 min
↓
4℃ ∞
【结果】
尝试用KOD FX对C. neoformans 菌落进行直接PCR,所有的样品均可确认到扩增,而用A公司高效率PCR酶,则几乎确认不到扩增。另外,以抽提・纯化后的基因组DNA为模板进行PCR,则都可确认到扩增。
【数据提供】
千叶大学真菌医学研究中心 李皓曼 老师、清水 公德 老师
【来自老师的评语】
以前对Cryptococcus neoformans进行PCR扩增,需要进行磁珠破碎等烦杂的前处理,或者使用很贵的DNA抽提试剂盒来纯化DNA。使用KOD FX,可直接对菌体进行PCR。本实验后,又有好几位实验室的老师、学生以各种不同的基因为目的片段进行PCR实验,都取得了很好的结果。