KOD FX实验例38: 用KOD FX对曲霉菌Aspergillus oryzae基因破坏的确认
实验例22: |
※本实验例发表在第61次 日本生物工学会大会(2009)上。
【背景】
进行曲霉菌基因破坏时进行确认,过去要进行DNA的抽提,非常麻烦,而本实验使用KOD FX,以只在溶液中加热过的曲霉菌的分生孢子为样品进行扩增,判定基因类型。
【样品】曲霉菌基因破坏候选菌株的分生孢子
【样品的处理】 ①取微量孢子在Buffer*(50 μl)中悬浊
*Buffer:100 mM Tris-HCl (pH 9.5), 1 M KCl, 10 mM EDTA
②95℃10分钟 →Vortex →上清1 μl / 50 μl PCR反应液
【基因名】推定酸性推定酸性羧肽酶carboxypeptidase(ACP)基因
【目的片段】3.6~5.2 kb
Fig. 1 引物的位置与扩增产物的大小
【反应液组成】取如说明书中记载
灭菌水 |
10 <μl> |
2x PCR Buffer for KOD FX |
25 |
2mM dNTPs |
10 (final 0.4mM) |
10 pmol/μl Primer F |
1.5 |
10 pmol/μl Primer R |
1.5 |
KOD FX (1U/μl) |
1 |
前处理样品溶液 |
1 |
Total |
50 μl |
【PCR循环】
94℃, 2min.
↓
[ 98℃, 10sec 68℃, 5min ] (35cycles)
【结果】
可明确地判定基因破坏菌株。
【评语】
过去,对曲霉菌、丝状菌等进行菌落PCR很困难,要判定基因破坏菌株时,需要抽提纯化基因组DNA,而使用KOD FX则无需该操作,可简便地对多重样品的克隆的基因类型进行判别。
【数据提供】
白鹤酒造株式会社 研究开发室
山下 伸雄 老师